Le Chromium iX, basé sur la technologie NextGEM, est un instrument de microfluidique permettant d’isoler des cellules ou des noyaux cellulaires à partir d’une suspension (échantillon biologique) en vue de réaliser des analyses de transcriptomique, de protéomique et/ou d’épigénétique en NGS à l’échelle de cellules ou de noyaux uniques.
Analyses possibles et non exhaustives à l’aide de l’instrument :
- Expression génique sur cellules ou noyaux uniques (Single Cell Gene Expression) sur tous types de cellules fraîches, ou sur cellules humaines et murines fixées au PFA 4%
- Caractérisation des régions accessibles de la chromatine (ATAC) à échelle de noyaux uniques, possible en combinaison de l’expression génique sur cellules ou noyaux uniques
- Amplification des séquences VDJ des lymphocytes T et B humains et murins frais en vue de réaliser un profilage immunitaire des organismes étudiés, à échelle de cellules uniques
Le Chromium iX permet d’isoler les cellules/noyaux de 1 à 8 échantillons par run, et permet l’analyse simultanée de 500 à 80.000 cellules ou noyaux uniques (jusqu’à 160.000 cellules en ayant recours au multiplexage). Le taux de capture est de maximum 65% et le taux de multiplets est de 0.8% pour 1000 cellules.
Principe de la technologie
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